学习生信数据挖掘最好准备好这几个软件

学习生信数据挖掘最好准备好这几个软件

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古人云:“工欲善其事,必先利其器”。所以在学习生信数据挖掘之前,我们必须准备好相关的软件。下面这几个软件是我们离不开的:

1
第一个软件
R,做生信百分之一百是离不开的软件(数据处理,统计分析,绘图),当然土豪除外(土豪有钱,什么都可以请人干,不需要安装软件,也不需要自己动手)。R是免费软件,可以直接到R官网下载安装(https://www.r-project.org/),非常容易下载和安装。

2
第二个软件
Cytoscape,这个软件基本上是离不开的,因为绝大多数文章的网络图都是通过这个软件绘制的。虽然这个软件是免费开源的(官网:https://cytoscape.org/),但是下载安装比较麻烦。因为它是基于java环境,要想安装这个软件就必须先安装就java,有时候可能下载java和Cytoscape需要大半天都不行。

3
第三个软件
UltraEdit, (官网:https://www.ultraedit.com/)这个软件可有可无,也用其他文本编辑器替代,这个软件整理一些文本数据和代码非常方便,处理也比较快,打开文件也比较快。但是这个软件有一个很大的缺点就是需要付费购买才可以使用,网上应该可以找到绿色免安装的版本。

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